Cum se calculează punctul izoelectric al peptidelor

Autor: Alice Brown
Data Creației: 1 Mai 2021
Data Actualizării: 16 Noiembrie 2024
Anonim
How To Calculate The Isoelectric Point of Amino Acids and Zwitterions
Video: How To Calculate The Isoelectric Point of Amino Acids and Zwitterions

Conţinut

Peptidele sunt fragmente de polimeri scurți compuși din aminoacizi. Fiecare peptidă are o anumită secvență de aminoacizi denotați cu un cod de trei litere sau doar unul; de exemplu, aminoacidul alanină este abreviat ca „Ala” sau „A”. Sarcina peptidelor în soluție depinde de aciditatea acesteia. Punctul izoelectric (pI) se referă la valoarea acidității soluției în care molecula peptidică are o sarcină netă egală cu zero. Solubilitatea peptidei este minimă în punctul izoelectric. Utilizați serverele web disponibile pentru a calcula valoarea pI pentru o secvență de aminoacizi a unei peptide.

Pasul 1

Secvențați peptida folosind codul dintr-o literă. De exemplu, dacă o peptidă are o secvență de aminoacizi Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanină - Serină - Acid glutamic - Leucină - Prolină), atunci secvența dintr-o literă ar fi „ASELP”. Dacă este necesar, consultați tabelul de conversie dintr-o literă în trei litere furnizat în secțiunea Resurse.


Pasul 2

Utilizați orice browser, cum ar fi Internet Explorer sau Firefox, pentru a introduce un server care calculează punctul izoelectric al unei peptide (pI); vezi Resurse.

Pasul 3

Tastați secvența de o literă a peptidei - în exemplul nostru, „ASELP” - în casetă și faceți clic pe „Calculare”.

Pasul 4

Citiți valoarea punctului izoelectric (pI) dată în linia „Teoretic pI / Mw” (pl teoretic). În exemplul nostru, pI este 4,00. Rețineți că serverul calculează și greutatea moleculară (Mw) a peptidei.